Rosalind - जैव सूचना विज्ञान के अध्ययन के लिए एक मंच

डीएनए

ओलंपियाड प्रोग्रामिंग समस्याओं को हल करने के लिए प्रसिद्ध साइटें हैं, जैसे कि, उदाहरण के लिए, टॉपकोडर और कोडफोर्सेस , साथ ही गणितीय पहेली समस्याओं का संग्रह, उदाहरण के लिए, प्रोजेक्ट यूलर । पिछले एक साल में, ऑनलाइन शिक्षा में एक उछाल आया है: शीर्ष अमेरिकी विश्वविद्यालयों से ऑनलाइन पाठ्यक्रम प्रदान करने वाले कौरसेरा और उडेसिटी हैं , ... लेकिन जो लोग जैव सूचना विज्ञान का अध्ययन करना चाहते हैं, उनके लिए अभी तक कुछ भी नहीं है।

रोसालिंड - मई 2012 से सेंट पीटर्सबर्ग और कैलिफोर्निया विश्वविद्यालय, सैन डिएगो में विकसित की जा रही एक परियोजना, बस इस जगह को भरती है। यह समस्या निवारण , मुफ्त और खुले का उपयोग करके जैव सूचना विज्ञान को पढ़ाने का एक मंच है

सभी प्रशिक्षण साइट के मुख्य सामग्री को बनाने वाले कार्यों के आसपास बनाया गया है:

छवि

प्रत्येक कार्य में एक जैविक औचित्य होता है और एक औपचारिक समाधान के लिए पर्याप्त कठोर सूत्रीकरण होता है। उदाहरण के लिए, बारहवें कार्य में, डीएनए के छोटे टुकड़ों से जीनोम को इकट्ठा करना आवश्यक है । यह भी बताता है कि अनुक्रमण क्या है और इसकी आवश्यकता क्यों है:

छवि

उपयोगकर्ता किसी भी प्रोग्रामिंग भाषा में और यहां तक ​​कि कागज के एक टुकड़े पर भी समस्याओं को हल कर सकता है, लेकिन साइट से एक परीक्षण डाटासेट डाउनलोड करने के बाद, उसके पास इसे संसाधित करने के लिए केवल पांच मिनट होंगे। यदि उत्तर गलत है, तो यह ठीक है, आप कई बार असीमित संख्या में प्रयास कर सकते हैं, लेकिन एक ही समय में, डेटासेट हर बार नए सिरे से तैयार किया जाता है।

सभी समस्याओं को तुरंत हल नहीं किया जा सकता है, या बल्कि, केवल पहले को तुरंत हल किया जा सकता है। कार्य एक निर्भरता ग्राफ में बनाए गए हैं ताकि सीखने की प्रक्रिया अधिक सार्थक हो और सामग्री को क्रम में महारत हासिल हो। लेकिन अगर आप में अधिक रुचि रखते हैं, उदाहरण के लिए, केवल जीनोम असेंबली, या अनुक्रम संरेखण, या कम्प्यूटेशनल प्रोटिओमिक्स, तो आप निर्भरता ग्राफ के साथ एक निश्चित दिशा में गहराई तक जा सकते हैं और अन्य समस्याओं को हल नहीं कर सकते हैं। इस प्रकार, चयनित विषय में अर्जित ज्ञान अधिक गहरा होगा।

छवि

और, ज़ाहिर है, साइट में प्रोफाइल, साथ ही गेम मैकेनिक्स की शुरुआत है: स्तर और बैज।

छवि

छवि

मुझे उम्मीद है कि रोजालिंड उन सभी के लिए उपयोगी होगा जो जैव सूचना विज्ञान की इस दिलचस्प दुनिया में उतरना चाहते हैं या बस कुछ नया सीखना चाहते हैं।

परियोजना सक्रिय रूप से विकसित हो रही है, इसलिए हम किसी भी आलोचना को सुनकर खुश हैं। विशेष रूप से, 26 अगस्त को, अंतरराष्ट्रीय सम्मेलन RECOMB जैव सूचना विज्ञान शिक्षा सेंट पीटर्सबर्ग में आयोजित किया जाएगा, जिसमें से एक मुख्य विषय रोजालिंड होगा।

प्रणाली पहले से ही अपने पाठ्यक्रमों में कार्यों के पुन: उपयोग का समर्थन करती है, तथाकथित "प्रोफेसर खाते", यही वजह है कि हम 2013 के वसंत में यूसीएसडी और हार्वे मुड की शैक्षिक प्रक्रिया में रोसालिंड को लागू करेंगे। रूस की मांग में ऐसा नहीं है, क्योंकि जैव सूचना विज्ञान पर कहीं और कोई कार्यक्रम नहीं हैं। लेकिन रोजालिंड के साथ, यह आसान हो जाता है - शायद वे करेंगे?

हम लगातार नए कार्य जोड़ रहे हैं: अब उनमें से 42 हैं और लगभग इतनी ही राशि मसौदा प्रतियों में है। हाल ही में, कार्यों के लिए कस्टम विचारों को स्वीकार करना और उनकी देखरेख करना संभव हो गया है ताकि जैव सूचना विज्ञान समुदाय सामग्री निर्माण प्रक्रिया में भाग ले सके। छवि

योजनाओं में यूसीएसडी में जैव सूचना विज्ञान पर व्याख्यान की वीडियो रिकॉर्डिंग और इस सामग्री के आधार पर कई ऑनलाइन पाठ्यक्रमों का निर्माण शामिल है।

PS इस परियोजना का नाम रोजालिंड फ्रैंकलिन के नाम पर रखा गया है, जिनके शोध से वाटसन और क्रिक ने डीएनए के सर्पिल ढांचे की खोज की। 37 साल की उम्र में इस खोज के लिए नोबेल पुरस्कार से सम्मानित किए जाने से चार साल पहले रोजलिंड की कैंसर से मृत्यु हो गई थी, क्योंकि उनकी वंशानुगत प्रवृत्ति थी और उन्होंने विकिरण के साथ बहुत काम किया।

Source: https://habr.com/ru/post/In149632/


All Articles